{"id":1651,"date":"2021-11-23T03:25:19","date_gmt":"2021-11-23T03:25:19","guid":{"rendered":"https:\/\/protechlab.cl\/enzimas-industriales\/?page_id=1651"},"modified":"2021-12-13T14:42:23","modified_gmt":"2021-12-13T14:42:23","slug":"resultados-3","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/protechlab.cl\/enzimas-industriales\/resultados-3\/","title":{"rendered":"Resultados 3"},"content":{"rendered":"\t\t<div data-elementor-type=\"wp-page\" data-elementor-id=\"1651\" class=\"elementor elementor-1651\" data-elementor-settings=\"[]\">\n\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-section-wrap\">\n\t\t\t\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-top-section elementor-element elementor-element-4d7e24d elementor-section-boxed elementor-section-height-default elementor-section-height-default\" data-id=\"4d7e24d\" data-element_type=\"section\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container elementor-column-gap-default\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-100 elementor-top-column elementor-element elementor-element-14b9ebd\" data-id=\"14b9ebd\" data-element_type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-6982786 elementor-widget elementor-widget-heading\" data-id=\"6982786\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"heading.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t<h3 class=\"elementor-heading-title elementor-size-default\">AN\u00c1LISIS DE SECUENCIA Y FUNCI\u00d3N<\/h3>\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-183986c elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"183986c\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-top-section elementor-element elementor-element-31501a8 elementor-section-boxed elementor-section-height-default elementor-section-height-default\" data-id=\"31501a8\" data-element_type=\"section\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container elementor-column-gap-default\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-100 elementor-top-column elementor-element elementor-element-13b5407\" data-id=\"13b5407\" data-element_type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-9b5d577 elementor-widget elementor-widget-shortcode\" data-id=\"9b5d577\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"shortcode.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-shortcode\"><style type=\"text\/css\">\r\n       .errordiv { padding:10px; 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text-align: justify;\">Este tipo de archivo hace una descripci\u00f3n en la primera l\u00ednea y el resto de las l\u00edneas que contiene el archivo entrega anotaci\u00f3n de datos de la secuencia deseada. La forma en que se diferencia cu\u00e1l es la l\u00ednea que proporciona la informaci\u00f3n descriptiva corresponde a aquella que tenga en su comienzo el s\u00edmbolo \u2018mayor que\u2019 (\u201c&gt;\u201d), por ende, el resto de las l\u00edneas que no lo presentan equivalen a la anotaci\u00f3n de la secuencia descrita. Finalmente, cabe se\u00f1alar que<\/p>\n<p style=\"padding-left: 40px;\">el formato FASTA entrega la informaci\u00f3n de manera continua, por lo tanto, no permite espacios o l\u00edneas en blanco en medio de la anotaci\u00f3n (NCBI, 2007).<\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-top-section elementor-element elementor-element-2b40264 elementor-section-boxed elementor-section-height-default elementor-section-height-default\" data-id=\"2b40264\" data-element_type=\"section\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container elementor-column-gap-default\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-100 elementor-top-column elementor-element elementor-element-383093a\" data-id=\"383093a\" data-element_type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-e40647e elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"e40647e\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t<p style=\"text-align: justify;\">Las prote\u00ednas cumplen la funci\u00f3n de catalizar funciones espec\u00edficas dentro de los organismos, esto ocurre en consideraci\u00f3n a su secuencia aminoac\u00eddica y su estructura tridimensional, quienes de acuerdo con su actividad se pueden clasificar por motivos, dominios, familias y superfamilias, entre otros.<\/p>\n\n<ul>\n \t<li style=\"text-align: justify;\">Motivo: Para referirse a un motivo, debemos observar un alineamiento m\u00faltiple de prote\u00ednas hom\u00f3logas y se puede ver que algunas columnas var\u00edan bastante, mientras que otras est\u00e1n m\u00e1s conservadas. Cuando observamos ciertas columnas cercanas con una alta conservaci\u00f3n, es decir, cuando encontramos fragmentos de las secuencias que se conservan m\u00e1s que otros y que podr\u00edan caracterizar funcionalmente a las prote\u00ednas, entonces solemos hablar de motivos.<\/li>\n \t<li style=\"text-align: justify;\">Dominio: As\u00ed tambi\u00e9n, el concepto de dominio define una unidad estructural independiente en las prote\u00ednas. Sin embargo, se utiliza con cierta laxitud: por ejemplo, en estudios gen\u00e9ticos de deleci\u00f3n, a veces se utiliza como sin\u00f3nimo de la parte m\u00ednima de la secuencia capaz de realizar la funci\u00f3n estudiada. En las bases de datos de dominios como PFam, un dominio se suele corresponder con el n\u00facleo del dominio estructural, aquella zona m\u00e1s similar entre todas las prote\u00ednas de una familia, aunque no tiene por qu\u00e9 coincidir exactamente con los l\u00edmites del dominio estructural.<\/li>\n<\/ul>\n<p style=\"text-align: justify;\">En este sentido es importante destacar que la funci\u00f3n de una prote\u00edna es es el resultado de las funciones del resultado de las funciones de sus dominios. Siendo as\u00ed, el dominio, y no el gen, la unidad evolutiva b\u00e1sica. Por lo tanto, se entiende los siguientes conceptos de la siguiente manera:<\/p>\n\n<ul>\n \t<li style=\"text-align: justify;\">Familia: Grupo de prote\u00ednas con una funci\u00f3n com\u00fan (jerarqu\u00eda subjetiva), las que se encuentran relacionadas evolutivamente, y en reiteradas ocasiones se considera sin\u00f3nimo de \u201cfamilia g\u00e9nica\u201d. Sin embargo, el concepto se debe confundir con familia usado en el sentido taxon\u00f3mico. Cabe destacar que las prote\u00ednas de una familia descienden de un antepasado com\u00fan y t\u00edpicamente poseen estructuras tridimensionales, funciones y secuencias similares.<\/li>\n \t<li>Superfamilia: Grupo de prote\u00ednas de extensi\u00f3n m\u00e1s macro con origen com\u00fan.<\/li>\n<\/ul>\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-top-section elementor-element elementor-element-6a79696 elementor-section-boxed elementor-section-height-default elementor-section-height-default\" data-id=\"6a79696\" data-element_type=\"section\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container elementor-column-gap-default\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-100 elementor-top-column elementor-element elementor-element-7fbc85e\" data-id=\"7fbc85e\" data-element_type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-932e150 elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"932e150\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t<p style=\"text-align: justify;\">En consideraci\u00f3n a dicha informaci\u00f3n, se entrega el siguiente gr\u00e1fico din\u00e1mico. Esta informaci\u00f3n est\u00e1 basada en el set de datos que se obtuvo desde <strong>UNIPROT<\/strong>, los cuales fueron clasificados en primera instancia seg\u00fan su aplicaci\u00f3n en la industria. Informaci\u00f3n detallada que se encuentra en la secci\u00f3n \u201cIndustrias Alimentarias\u201d.<\/p>\n\n<ul>\n \t<li>Universal Protein Resource \/ <strong>UNIPROT<\/strong><\/li>\n<\/ul>\n<p style=\"padding-left: 40px; text-align: justify;\">El Universal Resource Protein (UniProt) corresponde a un recurso central en el \u00e1mbito de la investigaci\u00f3n y anotaci\u00f3n de genomas y prote\u00f3mica. Esto se debe a que corresponde a un recurso central de almacenamiento de la informaci\u00f3n, siendo de esta forma el cat\u00e1logo m\u00e1s amplio, estable y de libre acceso, que proporciona las secuencias de prote\u00ednas y su anotaci\u00f3n funcional. UniProt es una colaboraci\u00f3n entre el Instituto Europeo de Bioinform\u00e1tica (EBI), el Recurso de Informaci\u00f3n de Prote\u00ednas (PIR) y el Instituto Suizo de Bioinform\u00e1tica (SIB). \u00c9ste presenta como principales funcionalidades otorgar archivos de secuencias (con el apoyo de an\u00e1lisis computacionales) y un sitio web que permite generar referencias cruzadas a otras bases de datos. UniProt se actualiza y distribuye cada tres semanas, y se puede acceder a este a trav\u00e9s de http:\/\/www.uniprot.org (The EMBL Outstation, 2007).<\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-top-section elementor-element elementor-element-3b10197 elementor-section-boxed elementor-section-height-default elementor-section-height-default\" data-id=\"3b10197\" data-element_type=\"section\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container elementor-column-gap-default\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-100 elementor-top-column elementor-element elementor-element-0f832d6\" data-id=\"0f832d6\" data-element_type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-669626a elementor-widget elementor-widget-spacer\" data-id=\"669626a\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"spacer.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-spacer\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-spacer-inner\"><\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-b542cdb elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"b542cdb\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t<p style=\"text-align: justify;\">Luego, cada tipo de enzima se subclasifica en los diversos an\u00e1lisis realizados y que determinan si cada secuencia proteica presenta un tipo de motivo, dominio, familia y superfamilia. Los cuales, se encuentran detallados en las siguientes bases de datos:<\/p>\n\n<ul>\n \t<li>PROSITE<\/li>\n<\/ul>\n<p style=\"padding-left: 40px; text-align: justify;\">Es una base de datos de familias de prote\u00ednas y dominio o sitio funcional, siendo este \u00faltimo la zona de mayor densidad, o sea, donde se centran en mayor proporci\u00f3n los plegamientos. Dicha informaci\u00f3n biol\u00f3gica permite determinar la funci\u00f3n de las prote\u00ednas analizadas, es por esto, que la plataforma web se ha redise\u00f1ado permitiendo al usuario descubrir nuevas regiones conservadas y visualizar los arreglos de los dominios identificados (Hulo et al., 2004).<\/p>\n<p style=\"text-align: justify; padding-left: 40px;\">Actualmente, tiene identificada en su base de datos 1154 dominios y se puede acceder a ella en http:\/\/prosite.expasy.org\/.<\/p>\n&nbsp;\n<ul>\n \t<li>Pfam<\/li>\n<\/ul>\n<p style=\"text-align: justify; padding-left: 40px;\">Es una base de datos de familias de prote\u00ednas, donde se define a las familias como conjuntos de regiones de prote\u00ednas que comparten un grado significativo de similitud de secuencia, lo que sugiere homolog\u00eda. De esta manera proporciona informaci\u00f3n completa de los dominios y las familias de prote\u00ednas, representados por alineamientos m\u00faltiples de secuencias y perfiles de Modelos de Markov. Por tanto, la utilizaci\u00f3n de esta biblioteca permitir\u00e1 comparar en<\/p>\n<p style=\"padding-left: 40px; text-align: justify;\">relaci\u00f3n a sus dominios y residuos de amino\u00e1cidos (Punta et al., 2012). En Diciembre de 2015 la base de datos contaba con m\u00e1s de 16.000 familias y actualmente se encuentra disponible en http:\/\/pfam.xfam.org\/.<\/p>\n&nbsp;\n<ul>\n \t<li>SUPERFAMILY<\/li>\n<\/ul>\n<p style=\"text-align: justify; padding-left: 40px;\">Base de datos que contiene perfiles de Modelos de Markov de todas las prote\u00ednas conocidas. \u201cUn modelo oculto de Markov describe una distribuci\u00f3n de probabilidad sobre un n\u00famero de secuencias potencialmente infinito\u201d (Eddy, 1998), de esta forma, genera un sistema de puntaje de posiciones espec\u00edficas basado en probabilidad, por lo que contiene diferentes estados para<\/p>\n<p style=\"padding-left: 40px; text-align: justify;\">coincidencia, inserci\u00f3n o eliminaci\u00f3n que son usados para modelar una familia de prote\u00ednas. Dichas prote\u00ednas, se clasifican seg\u00fan un ancestro com\u00fan evolutivo. Proporcionando as\u00ed, informaci\u00f3n estructural, funcional y evolutiva de las prote\u00ednas (Wilson et al., 2009).<\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t<section class=\"elementor-section elementor-top-section elementor-element elementor-element-19ec579 elementor-section-boxed elementor-section-height-default elementor-section-height-default\" data-id=\"19ec579\" data-element_type=\"section\">\n\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-container elementor-column-gap-default\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-column elementor-col-100 elementor-top-column elementor-element elementor-element-857cbe5\" data-id=\"857cbe5\" data-element_type=\"column\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-widget-wrap elementor-element-populated\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-c521fcb elementor-widget elementor-widget-spacer\" data-id=\"c521fcb\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"spacer.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"elementor-spacer\">\n\t\t\t<div class=\"elementor-spacer-inner\"><\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-8af0cb9 elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"8af0cb9\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t\t\t\t\t\t<p style=\"text-align: justify;\">Finalmente, se encuentra como \u00faltima clasificaci\u00f3n cada uno de los motivos, dominios, familias y superfamilias que se encuentran presentes en el grupo de prote\u00ednas con determinada funci\u00f3n catal\u00edtica. Es en este gr\u00e1fico donde podemos visualizar la cantidad de secuencias que presenta determinado dominio y que en algunos de los casos, se vincula de forma directa con la funci\u00f3n que cataliza.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">La informaci\u00f3n que se visualiza es parte de lo contenido en nuestra base de datos local creada por PROTECH y la cual se encuentra localizada en nuestros servidores. Para esto, se utiliza el sistema <strong>PostgreSQL<\/strong>, que almacena los datos y permite un r\u00e1pido filtrado de la informaci\u00f3n.<\/p>\n&nbsp;\n<ul>\n \t<li><strong>PostgreSQL<\/strong><\/li>\n<\/ul>\n<p style=\"padding-left: 40px; text-align: justify;\">Sistema de gesti\u00f3n de bases de datos objeto-relacional, distribuido bajo licencia BSD y con su c\u00f3digo fuente disponible libremente. PostgresQL es un proyecto de c\u00f3digo abierto, lo que conlleva a que es dirigido por una comunidad de desarrolladores que trabajan de forma altruista, libre y\/o apoyados por organizaciones comerciales. Dicha comunidad es denominada el PostgreSQL Global Development Group (PGDG) (The PostgreSQL Global Development Group, 2016).<\/p>\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>AN\u00c1LISIS DE SECUENCIA Y FUNCI\u00d3N Entre los diversos an\u00e1lisis aplicados a cada tipo de prote\u00edna, se encuentra el procesamiento de estas en un gran n\u00famero de bases de datos disponibles &#8230;<\/p>\n","protected":false},"author":3,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/protechlab.cl\/enzimas-industriales\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1651"}],"collection":[{"href":"https:\/\/protechlab.cl\/enzimas-industriales\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/protechlab.cl\/enzimas-industriales\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/protechlab.cl\/enzimas-industriales\/wp-json\/wp\/v2\/users\/3"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/protechlab.cl\/enzimas-industriales\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1651"}],"version-history":[{"count":10,"href":"https:\/\/protechlab.cl\/enzimas-industriales\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1651\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1677,"href":"https:\/\/protechlab.cl\/enzimas-industriales\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1651\/revisions\/1677"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/protechlab.cl\/enzimas-industriales\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1651"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}